La fragmentación
interna es la pérdida de espacio en disco debido al hecho de que el tamaño de
un determinado archivo sea inferior al tamaño del clúster, ya que teóricamente el archivo
estaría obligado a ser referenciado como un clúster completo. Los clústeres son
contiguos de forma que desde el último bit del archivo situado en el clúster
"a" hasta el primer bit del archivo situado en el clúster contiguo
(es decir "b") queda un espacio sobrante siempre teniendo la
condición de que el archivo del clúster "a" fuera más pequeño que el
clúster en sí.
Este tipo de fragmentación aparece como consecuencia de las distintas políticas de ajuste de bloques que tiene un sistema de ficheros, o al utilizar asignaciones dinámicas de bloques en el caso de la memoria. En el sistema de ficheros, la sucesiva creación y eliminación de ficheros de distintos tamaños puede conducir al aislamiento de los bloques libres de un disco y, dependiendo de la política de ajuste, su no elección para futuros ficheros.En la memoria del sistema la fragmentación se produce cuando los procesos asignados han ocupado posiciones no contiguas de memoria dejando demasiados bloques libres de pequeño tamaño, en los que no caben nuevos procesos
